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각각 따로 BFS를 돌려주었습니다.
import java.util.*;
import java.io.*;
public class Main {
public static void main(String[] args) throws IOException{
BufferedReader br = new BufferedReader(new InputStreamReader(System.in));
int[] dx = new int[]{1, 0, -1 ,0};
int[] dy = new int[]{0, 1, 0, -1};
int[] result = new int[2];
int N = Integer.parseInt(br.readLine());
String[][] painting = new String[N][N];
boolean[][] visited1 = new boolean[N][N];
boolean[][] visited2 = new boolean[N][N];
for (int i=0; i<N; i++)
painting[i] = br.readLine().split("");
for (int i=0; i<N; i++){
// 적록색약 아닌사람
for (int j=0; j<N; j++){
// 방문했으면 지나갑니다,,
if (visited1[i][j]) continue;
result[0]++;
// BFS를 돌릴 현재 위치가 무슨 색인지
String curColor = painting[i][j];
Queue<int[]> Q = new LinkedList<>();
Q.offer(new int[]{i, j});
visited1[i][j] = true;
while (!Q.isEmpty()){
int[] cur = Q.poll();
for (int dir=0; dir<4; dir++){
int nx = cur[1] + dx[dir];
int ny = cur[0] + dy[dir];
if (nx<0 || nx>=N || ny<0 || ny>=N) continue;
if (visited1[ny][nx] || !painting[ny][nx].equals(curColor)) continue;
visited1[ny][nx] = true;
Q.offer(new int[]{ny, nx});
}
}
}
// 적록색약인 사람
for (int j=0; j<N; j++){
// 방문했으면 지나갑니다,,
if (visited2[i][j]) continue;
result[1]++;
// BFS를 돌릴 현재 위치가 무슨 색인지
String curColor = painting[i][j];
Queue<int[]> Q = new LinkedList<>();
Q.offer(new int[]{i, j});
visited2[i][j] = true;
while (!Q.isEmpty()){
int[] cur = Q.poll();
for (int dir=0; dir<4; dir++){
int nx = cur[1] + dx[dir];
int ny = cur[0] + dy[dir];
if (nx<0 || nx>=N || ny<0 || ny>=N) continue;
if (visited2[ny][nx]) continue;
if (curColor.equals("R") || curColor.equals("G"))
if (painting[ny][nx].equals("B")) continue;
if (curColor.equals("B") && !painting[ny][nx].equals("B")) continue;
visited2[ny][nx] = true;
Q.offer(new int[]{ny, nx});
}
}
}
}
System.out.print(result[0] + " " + result[1]);
}
}
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